上海中医药大学附属曙光医院是三级甲等综合性中医院、上海十大综合性医院之一、全国示范中医院。曙光医院肛肠科是上海地区历史最悠久、医疗规模最大、就诊病人数最多的中医肛肠科。专科于1956年以海上痔科名家陈泽超主持的痔科门诊为发端，1990年在上海地区率先成立中医肛肠科，1992年被定为上海市肛肠病医疗协作中心，经陈泽超、柏连松、杨巍三代带头人的培育，现已成为融医、教、研为一体的中医特色重点专科，享誉海内外。

曙光医院肛肠科是国家中医药管理局“十二·五”重点专科、中国女医师协会肛肠专业委员会会长单位、中华中医药学会全国肛肠专业继续教育基地、国家食品药品监督管理局药物临床试验机构、上海市中医肛肠临床基地、上海市“十三·五”中医临床重点专科、上海市卫生局中医特色肛肠专科、上海市中医临床优势专科、中医肛肠科学博士研究生培养点、上海市海派中医流派夏氏外科传承研究基地重要组成科室，设有柏连松名医工作室和杨巍名中医工作室。作为上海中医肛肠专科联盟建设牵头单位，制定联盟各级单位的中医肛肠优势病种诊疗方案和中医特色诊疗技术，建立了中医肛肠优势病种中医分层分级诊疗制度。专科按照国家中医药管理局的要求，医院设置重点专科建设办公室，部署各专科制定建设发展规划、工作计划和发挥中医药特色和提高中医临床疗效的具体措施，确定重点病种，针对难点进行科学研究，同时每年度对各专科诊疗方案、临床疗效进行评价，提出解决难点的思路和措施，不断加强中医诊疗方案的推广和临床路径的实施，开展临床经验整理、应用及名老中医的传承工作，建立重点专科信息库。应用院内制剂和本专科特色诊疗技术于临床。

曙光医院肛肠科近年来承担了国家科技部“十一·五”、“十二·五”项目2项；国家中医药管理局项目1项；上海市科委、教委、卫生局等科研课题20多项。研究成果先后获奖5次：国家中医药管理局科技进步三等奖1项、上海市科技进步二等奖1项、上海市中西医结合科技进步三等奖2项，中华中医药学会科学技术奖1项。培养研究生70余名，其中博士研究生15名，主编参编专著13部；发表论文100余篇，其中SCI收录13篇，影响因子最高79.258。本专科拥有十余种系列中药自制制剂。

本专业作为临床药物试验机构的中医肛肠专业于2006年通过SFDA的现场认证，科室11人通过GCP培训，参加药物临床试验7项。目前，本专科已制定混合痔、肛裂、低位单纯性肛瘘中医诊疗规范及肛肠术后中药熏洗疗法的标准操作规范，并进行有效的质量控制，同时开展克罗恩肛瘘、高位复杂性肛瘘、环状混合痔和出口梗阻型便秘中医诊疗规范的临床研究。2011年成立中国TST技术培训基地、2013年成立中国RPH技术培训基地，科室每年开办技术学习班通过手术演示及理论学习等方式，对国内外与会肛肠专业学员进行培训及指导，旨在普及新理论，介绍新技术，谋求肛肠学科的共同提高，共同发展。